Die Medizinische Klinik II besitzt die volle Weiterbildungsermächtigung für die Gastroenterologie. In der Klinik in Gütersloh, arbeiten 4 Ärzte mit der Zusatzweiterbildung Gastroenterologie. Die Endoskopie stellt einen wichtigen Schwerpunkt der Klinik mit inzwischen jährlich fast 5000 Untersuchungen dar.

Die Endoskopie wurde Endes des Jahres 2009 apparativ vollständig erneuert. Mit Ausnahme der Kapselendoskopie werden alle etablierten und modernen endoskopischen Verfahren durchgeführt.

Auf Zuweisung aller niedergelassenen Ärzte werden Indikationskoloskopien als ambulanter endoskopischer Eingriff durchgeführt.

Ein Teil des Pflegepersonals besitzt die Zusatzqualifikation Endoskopie und ist aktiv an deutschlandweiten Fort- und Weiterbildungsveranstaltungen für Pflegekräfte beteiligt.